Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms