Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn3aA2ASI5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms