Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Patl2A2ARM1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms