Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb1A2AQ07 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms