Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttll9A2APC3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttll9A2APC3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttll9A2APC3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttll9A2APC3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttll9A2APC3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttll9A2APC3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ttll9A2APC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms