Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FocadA2AKG8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms