Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn6A2AJB9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lcn6A2AJB9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms