Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brwd3A2AHJ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms