Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Camsap1A2AHC3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Camsap1A2AHC3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Camsap1A2AHC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Camsap1A2AHC3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Camsap1A2AHC3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Camsap1A2AHC3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Camsap1A2AHC3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Camsap1A2AHC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Camsap1A2AHC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Camsap1A2AHC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Camsap1A2AHC3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Camsap1A2AHC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms