Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn34dA2AGU5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms