Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms