Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb561d1A2AE42 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms