Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms