Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprfA2A8L5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PtprfA2A8L5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PtprfA2A8L5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PtprfA2A8L5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprfA2A8L5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PtprfA2A8L5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprfA2A8L5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprfA2A8L5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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