Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm2A2A7B5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm2A2A7B5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms