Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pabpc1lA2A5N3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms