Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4921501E09RikA0A0R4J054 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms