Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B654

Trav3-4, T cell receptor alpha variable 3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-4A0A075B654 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav3-4A0A075B654 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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