Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 4930509G22Rik-201ENSMUST00000181206 2481 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Rnf43-201ENSMUST00000040089 3670 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Nek11-201ENSMUST00000038648 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Zfp658-202ENSMUST00000107972 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Cd84-204ENSMUST00000136479 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Fkbp5-202ENSMUST00000114792 3858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Prokr1-201ENSMUST00000050887 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Thbs3-201ENSMUST00000029682 3190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Hnrnpk-201ENSMUST00000043269 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Utp14a-201ENSMUST00000080713 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Atxn7l1os1-201ENSMUST00000155877 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm38252-201ENSMUST00000192701 2616 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms