Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Chn2-203ENSMUST00000114401 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm7942-201ENSMUST00000163216 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms