Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cd200-202ENSMUST00000163230 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4933432K03Rik-203ENSMUST00000206276 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Asic2-202ENSMUST00000066197 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Trim66-201ENSMUST00000033339 4354 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Osgepl1-202ENSMUST00000114484 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rhpn2-202ENSMUST00000085556 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Odf2-210ENSMUST00000113765 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zbtb44-206ENSMUST00000217092 2472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Luzp1-207ENSMUST00000170102 7526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fabp12-201ENSMUST00000029043 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Wfs1-202ENSMUST00000166339 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rnf38-204ENSMUST00000107836 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Stx16-202ENSMUST00000087908 3865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Slc4a2-203ENSMUST00000115049 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms