Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Hp1bp3-214ENSMUST00000165861 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Rcbtb2-209ENSMUST00000164822 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Col6a1-201ENSMUST00000001147 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Xpnpep2-203ENSMUST00000115000 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 C820005J03Rik-201ENSMUST00000195997 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Zmiz2-202ENSMUST00000102914 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Brd9-201ENSMUST00000099384 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Arhgap27-201ENSMUST00000041385 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Klhl20-201ENSMUST00000111611 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Olfr156-201ENSMUST00000079234 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Epb41l3-215ENSMUST00000225977 3188 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Skap2Q3UND0 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms