Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Trav9-1-201ENSMUST00000103581 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Trav9-4-201ENSMUST00000103662 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm18200-201ENSMUST00000173265 833 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm18190-201ENSMUST00000174801 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Trav9d-1-201ENSMUST00000178426 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm28233-201ENSMUST00000189360 356 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm6204-201ENSMUST00000198872 457 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Morc3-202ENSMUST00000201097 2918 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Olfr323-203ENSMUST00000214132 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Cinp-202ENSMUST00000220607 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm15005-201ENSMUST00000117639 512 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm9670-201ENSMUST00000121201 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm14996-201ENSMUST00000178488 512 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm14992-201ENSMUST00000179437 512 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm11239-202ENSMUST00000179977 1080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 1700120C14Rik-201ENSMUST00000187706 326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Scgb2b1-201ENSMUST00000189372 338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Oaz3-206ENSMUST00000204548 787 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Tubb3-202ENSMUST00000212743 776 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AI182371-201ENSMUST00000045776 1724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 C1qtnf3-202ENSMUST00000110523 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm12980-201ENSMUST00000118912 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm11662-201ENSMUST00000121389 1193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ociad1-207ENSMUST00000201556 999 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm8689-201ENSMUST00000218709 712 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm12691-202ENSMUST00000222516 918 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AC129019.1-201ENSMUST00000223463 410 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 CT025533.1-201ENSMUST00000227485 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ugt1a9-201ENSMUST00000073772 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ces5a-201ENSMUST00000077816 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Rhox4c-201ENSMUST00000115183 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm9126-201ENSMUST00000117072 416 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Myhas-201ENSMUST00000137662 787 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms