Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf1P39428 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf1P39428 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf1P39428 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf1P39428 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf1P39428 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Traf1P39428 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf1P39428 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Olfr1229-201ENSMUST00000099788 1019 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Apom-201ENSMUST00000025249 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Dmbx1-202ENSMUST00000084338 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Traf1P39428 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms