Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Rbm5-214ENSMUST00000182659 3205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm30373-202ENSMUST00000217507 2709 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Hdac7-204ENSMUST00000116409 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 AC102847.1-201ENSMUST00000228390 2498 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Pcx-204ENSMUST00000224726 4034 ntAPPRIS P3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Btnl6-201ENSMUST00000075483 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Samd15-202ENSMUST00000182869 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Polr3c-206ENSMUST00000154679 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Ttc16-205ENSMUST00000161089 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm42765-202ENSMUST00000200017 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm3912-202ENSMUST00000210164 643 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Klk1b4-201ENSMUST00000077354 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm36958-201ENSMUST00000192388 1875 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Pitrm1-201ENSMUST00000021611 3318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Tmem19-204ENSMUST00000217887 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Ube2k-207ENSMUST00000202082 4506 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Olfr1328-201ENSMUST00000081960 944 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Skap2Q3UND0 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms