Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5114W4VSN8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5114W4VSN8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5114W4VSN8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms