Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac6Q9Z2V5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac6Q9Z2V5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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