Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Letm1Q9Z2I0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Letm1Q9Z2I0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm1Q9Z2I0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms