Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd1Q9Z2E2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd1Q9Z2E2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms