Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Mbd3Q9Z2D8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mbd3Q9Z2D8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms