Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms