Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne2Q9Z238 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms