Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc45Q9Z1X9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc45Q9Z1X9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms