Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20bQ9Z104 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmg20bQ9Z104 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmg20bQ9Z104 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms