Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms