Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms