Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms