Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrf1Q9WU00 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms