Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp18Q9WTV6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms