Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sorbs3Q9R1Z8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sorbs3Q9R1Z8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sorbs3Q9R1Z8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sorbs3Q9R1Z8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sorbs3Q9R1Z8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorbs3Q9R1Z8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms