Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim3Q9R1R2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim3Q9R1R2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms