Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms