Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1076.1 ms