Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AmfrQ9R049 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms