Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a3Q9QZS0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms