Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms