Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clcf1Q9QZM3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 609.2 ms