Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ClnkQ9QZE2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ClnkQ9QZE2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms