Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmlQ9QZD5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChmlQ9QZD5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms