Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn8Q9QZ49 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn8Q9QZ49 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.2 ms